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如何预测LncRNA靶基因

2023-01-16 07:06:28 编辑:leo 浏览量:628

如何预测LncRNA靶基因

如何预测LncRNA靶基因

有免费的在线数据库可以预测,比如 StarBase,这是一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,整合多个预测软件,预测miRNA靶基因,包含了miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。构建了最全面的包含了14种癌症类型(>6000个样本)Pan-Cancer(泛癌)表达图谱和互作网络。

标签:LncRNA,基因,预测